Kajian Molekuler Patogenisitas Virus Avian Influenza Isolat Lampung 2004 – 2013

velaboPenyakit Avian Influenza merupakan penyakit unggas yang bersifat infeksius disebabkan oleh virus Avian influenza tipe A yang merupakan keluarga Orthomyxoviridae. Wabah AI pada unggas air di Lampung diidentifikasi pada tahun 2012. Penelitian ini bertujuan untuk  melakukan karakterisasi susunan asam amino pada daerah cleavage site sebagai penentuan patogenesitas isolat. Isolat dilakukan identifikasi subtipe H5N1 dengan tehnik  Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR). Amplifikasi gen HA menggunakan primer referens dari Australian Animal Health Laboratory (AAHL) Geelong Australia dan dilanjutkan dengan proses sekuensing. Analisis hasil sekuensing dengan menggunakan perangkat lunak MEGA versi 5.05 didapatkan isolat Lampung dari tahun 2004-2013 termasuk virus highly pathogenic avian influenza dengan pola susunan asam amino pada cleavage site QRERRRKKRG, QRESRRKKRG dan QRERRRKG

Avian Influenza is an infectious fowl disease caused by avian influenza virus type A that belongs to Orthomyxoviridae family. Avian influenza epidemics in water fowls had been identified in Lampung in 2012. The objective of this research was to find characterization of amino acid in cleavage site as isolate pathogenicity determination. Isolate was identified with sub type H5N1 identification with Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR). Amplification of gen HA used primary reference from Australian Animal Health Laboratory (AAHL) Geelong Australia and was followed with sequencing process. The sequencing analysis result by using MEGA software version 5.05 found Lampung isolates from 2004 – 2013 including highly pathogenic avian influenza virus with amino acid sequence QRERRRKKRG, QRESRRKKRG and QRERRRKG in cleavage site

oleh: Srihanto, E.A  –  Laboratorium Bioteknologi

download

BERITA TERKINI